Los Anales del Instituto de la Patagonia tienen por misión la publicación de trabajos originales e inéditos realizados preferentemente, aunque no exclusivamente, por los investigadores de la Universidad de Magallanes y sus colaboradores e invitados especiales, como así también por autores externos, en los campos de las Ciencias Naturales referidos a la Patagonia en sentido amplio, la Tierra del Fuego, la Antártica e islas adyacentes y el océano Pacífico sur-oriental.